Macにpyenv+opencvをインストールしたいのです

pyenv install 2.7.3 でインストールしたもの (A)

npymath.ini が見つからないエラー
scipyがインストール出来ない

pyenv virtualenv --distribute 2.7.3 venc27 でインストールしたもの (B)

libpython2.7.a (libpython2.7.dylib) が見つからない？

scipyはインストールできる
matplotlibがインストール出来ない
CC=clang pip install matplotlib なら通る

Linux(Ubuntu) でインストールしてみる (C)

Ubuntuなら動く

(A) とコレ(C) を比較してみると (A)には PYTHON_PATH/lib/python2.7/site-packages/numpy/core の下に lib ディレクトリが無い => numpyのインストールに失敗では？

numpyがきちんとインストールされない => opencvのpythonモジュールはnumpy必須なのでインストール出来ない

A,B はnumpyがきちんとインストールされていないであろうと思われる

どちらも numpyのimport_array() でsegfalしてる

このとき使ったインストールスクリプト

# brew switch ffmpeg 1.0

VERSION=2.4.3
INSTALL_DIR=$HOME/lib/opencv
# PYTHON_HOME=$HOME/.pyenv/versions/venv27
PYTHON_HOME=$HOME/.pyenv/versions/2.7.3
PYTHON_VERSION=2.7

mkdir -p opencv
cd opencv

curl -L http://sourceforge.net/projects/opencvlibrary/files/opencv-unix/${VERSION}/OpenCV-${VERSION}.tar.bz2/download -o OpenCV-${VERSION}.tar.bz2
tar jxvf OpenCV-${VERSION}.tar.bz2

mkdir -p ${INSTALL_DIR}
cd OpenCV-${VERSION}

mkdir -p build
cd build

cmake \
  -G "Unix Makefiles" \
  -D CMAKE_BUILD_TYPE=RELEASE \
  -D CMAKE_INSTALL_PREFIX=$INSTALL_DIR \
  -D BUILD_NEW_PYTHON_SUPPORT=ON \
  -D PYTHON_LIBRARY=$HOME/.pyenv/versions/2.7.3/lib/libpython${PYTHON_VERSION}.a \
  -D PYTHON_EXECUTABLE=$PYTHON_HOME/bin/python \
  -D PYTHON_PACKAGES_PATH=$PYTHON_HOME/lib/python${PYTHON_VERSION}/site-packages \
  -D PYTHON_INCLUDE_DIR=$PYTHON_HOME/include/python${PYTHON_VERSION} ..

make -j4
make install

ScipySuperpackの力を借りる (D)

ScipySuperpack

(A) や (B) とほぼ同じ import_array() でsegfalする

Anacondaの力を借りる (E)

scipy勉強会で知ったAnacondaを入れてみる

Anaconda - Scalable Data Analytics and Scientific Computing in Python

パッケージコレクション
Anaconda CE は無料
同梱されているパッケージはこちら http://docs.continuum.io/anaconda/1.3/pkgs.html
Mac用はOpenCVは同梱されていない
ローカルディレクトリにインストールできる
matplotlibやqt, scikit-learnやpandas, cythonまで一緒にインストールされるお手軽！！

Anaconda すんなり入りませんでした

libgcc_s.1.dylibがない

Python 2.7.3 :: Continuum Analytics, Inc.
creating default environment...
Traceback (most recent call last):
  File "/Users/yano/lib/anaconda/pkgs/conda-1.3.5-py27_0/lib/python2.7/site-packages/conda/install.py", line 28, in <module>
    import json
  File "/Users/yano/lib/anaconda/pkgs/python-2.7.3-6/lib/python2.7/json/__init__.py", line 108, in <module>
    from .decoder import JSONDecoder
  File "/Users/yano/lib/anaconda/pkgs/python-2.7.3-6/lib/python2.7/json/decoder.py", line 5, in <module>
    import struct
  File "/Users/yano/lib/anaconda/pkgs/python-2.7.3-6/lib/python2.7/struct.py", line 1, in <module>
    from _struct import *
ImportError: dlopen(/Users/yano/lib/anaconda/pkgs/python-2.7.3-6/lib/python2.7/lib-dynload/_struct.so, 2): Library not loaded: /usr/local/lib/libgcc_s.1.dylib
  Referenced from: /Users/yano/lib/anaconda/pkgs/python-2.7.3-6/lib/python2.7/lib-dynload/_struct.so
  Reason: image not found

みたいなエラーがでたので ln -s /usr/lib/libgcc_s.1.dylib /usr/local/lib/libgcc_s.1.dylib した

gccはbrewからインストールしたgccを使っている

hfx_codecがインポートされてない

LookupError: unknown encoding: hex

と出てインストールが停止する。インストールスクリプトはAnacondaのインストール指定したディレクトリに展開されているので ~/lib/anaconda/pkgs/conda-1.3.5-py27_0/lib/python2.7/site-packages/conda/install.py に from encodings import hex_codec を追加して、インストールを再開

Anacondaのインストーラーのシェルスクリプトから抜き出したものを再度実行する

PREFIX=/Users/yano/lib/anaconda
PYTHON=python

echo "creating default environment..."
CONDA_INSTALL="$PREFIX/pkgs/conda-1.3.5-py27_0/lib/python2.7/site-packages/conda/install.py"
$PYTHON $CONDA_INSTALL --prefix=$PREFIX --pkgs-dir=$PREFIX/pkgs --activate-all || exit 1
echo "installation finished."

pyenvにAnacondaを管理させるには

pyenvは ~/.pyenv/versions ディレクトリ以下にPYTHON_PATHにあたるディレクトリをまるっと移動させてやるとそれだけで認識してくれるので、 ~/lib/anaconda にインストールしたPythonとライブラリを anaconda ディレクトリをそのまま ~/.pyenv/versions/anaconda として移動してやれば大丈夫だと思いましたが、どうやらanacondaがインストールするライブラリの参照しているパスや、shebangのパスが /usr/bin/env python でなく決め打ちになっているので、インストール時に指定するパスを ~/.pyenv/versions/anaconca としましょう。

Anacondaのインストールはこれで終わり！

Anaconda環境にOpenCVをインストールする

さっきと同じようなスクリプトで。違いはPYTHON_HOMEとcmakeのPYTHON_LIBRARY

VERSION=2.4.3
INSTALL_DIR=$HOME/lib/opencv
PYTHON_HOME=$HOME/.pyenv/versions/anaconda
PYTHON_VERSION=2.7

mkdir -p opencv
cd opencv

curl -L http://sourceforge.net/projects/opencvlibrary/files/opencv-unix/${VERSION}/OpenCV-${VERSION}.tar.bz2/download -o OpenCV-${VERSION}.tar.bz2

tar jxvf OpenCV-${VERSION}.tar.bz2

mkdir -p ${INSTALL_DIR}
cd OpenCV-${VERSION}

mkdir -p build
cd build

cmake \
  -G "Unix Makefiles" \
  -D CMAKE_BUILD_TYPE=RELEASE \
  -D CMAKE_INSTALL_PREFIX=$INSTALL_DIR \
  -D BUILD_NEW_PYTHON_SUPPORT=ON \
  -D PYTHON_LIBRARY=$PYTHON_HOME/lib/libpython${PYTHON_VERSION}.dylib \
  -D PYTHON_EXECUTABLE=$PYTHON_HOME/bin/python \
  -D PYTHON_PACKAGES_PATH=$PYTHON_HOME/lib/python${PYTHON_VERSION}/site-packages \
  -D PYTHON_INCLUDE_DIR=$PYTHON_HOME/include/python${PYTHON_VERSION} ..

make -j4
make install

cv2.soが参照しているライブラリのパスがおかしい

先程はDYLD_FALLBACK_LIBRARY_PATHを設定することで、この問題を回避しました。

libpython2.7.dylibのパスがおかしいのですが、では、どこを参照しているかというと、 /opt/anaconda1anaconda2anaconda3/lib/libpython2.7.dylib とかふざけたパスが設定されてるので、これをinstall_name_tool で修正します

% cd ~/.pyenv/versions/anaconda/lib/python2.7/site-packages
% install_name_tool -change /opt/anaconda1anaconda2anaconda3/lib/libpython2.7.dylib @executable_path/../lib/libpython2.7.dylib ./cv2.so

実行するpythonが~/.pyenv/versions/anaconda/binにあるので@executable_pathからの相対パスでいいと思います

追記：パスを修正するスクリプトを書きました >>

OpenCVのライブラリのパスはDYLD_LIBRARY_PATHに

追記：OpenCVのライブラリをanacondaに突っ込むスクリプトを書きました >>

~~OpenCVのライブラリのパスはずっとこのままの予定なので、DYLD_LIBRARY_PATHにセットしちゃいます~~

~~```sh~~

opencv

if [ -n "$DYLD_LIBRARY_PATH" ]; then export DYLD_LIBRARY_PATH=$DYLD_LIBRARY_PATH:~/lib/opencv/lib else export DYLD_LIBRARY_PATH=~/lib/opencv/lib fi

</del>

<del>
ライブラリパスを修正したのとpyenvで管理するようになったので、
`PATHとDYLD_FALLBACK_LIBRARY_PATH の設定`で設定した環境変数は両方要らなくなりました。消しましょう
</dek>


これで`penv global anaconda`などでanacondaのpythonが使えるようになって、
さらにimport cvしてもsegfalしなくなりました。やったね！

# まとめ

- Anaconda便利
- OpenCVのpythonモジュールインストールすげぇはまるというか鬼門はnumpyだと思う
- pyenvとAnacondaは共存できる！

eckrel Dev

import cv がsegfalするので AnacondaでOpenCVしたMacの話